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1、概念不同。
应用程序（applicationsoftware或?application?Program）是计算机软件的主要分类之一，是指为针对用户的某种特殊应用目的所撰写的软件。
应用程序在分类上也比较多，系统应用程序，桌面应用程序，驱动应用程序，网络应用程序，手机应用程序，物联网应用程序等。
根据《软件工程：实践者的研究方法》中的定义，软件（software）是一系列按照特定顺序组织的计算机数据和指令，是计算机中的非有形部分。计算机中的有形部分称为硬件，由计算机的外壳及各零件及电路所组成。
软件由一个或多个应用程序组合而成，分类上有编程语言、系统软件、恶意软件，嵌入式软件，游戏软件，应用软件和介于这两者之间的中间件。
系统软件就是常见的操作系统，Windows，MacOS，Linux都是操作系统软件。
应用软件是需要运行在操作系统上的软件，比如常见的文档处理软件，图像处理软件，编程软件等。
恶意软件会故意造成隐私或机密数据外泄、系统损害（包括但不限于系统崩溃等）、数据丢失等故障及信息安全问题。
中间件是一种独立的系统软件或服务程序，分布式应用软件借助这种软件在不同的技术之间共享资源。
软件包括所有在计算机运行的程序，和其架构无关，例如可执行文件、库及脚本语言都属于软件。软件不分架构，有其共通的特性。?
应用程序只是软件的一部分，而软件的概念及其广泛，不是只有应用程序。
2、功能不同
软件由多个应用程序组合而成，功能及其复杂，比如常见的office软件，能做表格，做PPT，处理文档等功能。
而应用程序功能比较单一，只能处理一类工作。PPT只能用来处理幻灯片，没有办法处理复杂表格，想要录制音频需要调用office软件包里录制音频的应用程序。
3、开发难度不同。
软件的开发难度要比应用程序大得多，由于需要多个应用程序配合，而且需要在不同的操作系统平台上发布，都是用不同的编程语言混合开发而成。
软件对性能有一定的要求，很少选择性能比较差的脚本语言开发，一般都是使用C++，Java这类编译型语言开发。
但编译型语言的问题是，有的语言设计不合理，历史积累，不够成熟等原因，造成开发起来较繁琐，调试比较困难，开发时间较长。因此一个功能完整的软件开发起来通常需要几年才能完成。
最常见的游戏软件就是如此，很多游戏软件的游戏引擎都是C++，C#这种编译型语言开发（有现成的也需要二次开发），也是整个游戏的灵魂，开发难度也是最大的。
而游戏的动作，事件等则选择LUA，JavaScript或者Python这些脚本语言开发。很多游戏大作都是跨平台的，开发周期最少的都在1年以上。
应用程序的功能相对比较单一，遇到的业务场景也不会很复杂。通常开发一个功能完善的应用程序，只需要几个月时间，复杂的应用程序最多1-2年就能完成。
应用程序通常对性能的需求没有软件那么大，很多解释型的脚本语言也可以开发。开发一个移动端手机应用程序（web应用程序），功能不算很复杂，开发周期都不长。通常一个完整的web应用程序，会分为客户端和服务端两部分。
客户端软件技术选型上，常用ReactNative或者flutter（IOS有自己的一套UI），服务端软件一般常用C++、Java、PHP、Python、Ruby等编程语言开发，通常都会同时在安卓和IOS平台上发布。?
百度百科——应用软件?
(美)?Rosger?S?Pressman著,《软件工程：实践者的研究方法（原书第六版）》第一章
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